erstmal Respekt dafür, dass ihr euch mit den zwei, doch noch sehr kleinen Kindern, diese weite Reise antut.
auch wenn ihr 6 Wochen habt, würde ich mich persönlich auf eines der beiden Länder konzentrieren. Es gibt einfach auf beiden so viel zu sehen, da sollte man sich nicht "stressen".
Allen voran mit den Kids ist es sicher angenehmer, wenn man mal etwas verweilen kann.
Mein Australien Aufenthalt ist leider schon zu lange her (2009) und beschränkte sich auf die Ostküste, Neuseeland ist zwar auch schon wieder fast 7 Jahre her, aber da gabs so viele schöne Ecken, da haben wir uns damals mit 3 Wochen für beide Inseln schon sehr viel vorgenommen.
Deshalb mein einziger Tipp, Zeit lassen und lieber sich etwas gemütlicher in einem Land fortbewegen.